北京海淀区食品经营许可证的办理材料准备和申请流程如下：

一、准备材料

1. 食品经营许可证申请书：申请人需填写食品经营许可证申请书，并按照要求进行填写。

2. 营业执照：申请人需提供营业执照副本原件及复印件。

3. 食品安全管理制度：申请人需制定食品安全管理制度，并提交给相关部门审查。

4. 从业人员健康证明：所有从业人员需经过健康检查，并取得健康证明。

5. 经营场所使用证明：申请人需提供经营场所的租赁合同或房产证明。

6. 其他可能要求的相关材料。

二、申请流程

1. 网上提交材料：申请人需在海淀区食品药品安全委员会办公室网站上提交相关材料。

2. 窗口递交材料：申请人需将准备好的材料提交给海淀区行政服务大厅市场监管局窗口。

3. 现场核查：市场监管局会派员对申请人的经营场所进行现场核查，检查是否符合相关法律法规的要求。

4. 审核批准：市场监管局对申请人提交的材料和现场核查情况进行审核，决定是否批准颁发食品经营许可证。

5. 领取证件：如果审核通过，申请人可以到海淀区行政服务大厅市场监管局窗口领取食品经营许可证。

需要注意的是，不同地区和不同类型的食品经营许可证所需要的材料和流程可能会略有不同，建议在申请前先咨询相关部门或者机构获取具体信息。