在丰台区办理食品经营许可证和卫生许可证的过程中，可能会遇到以下疑难问题：

1. 申请材料不齐全或不符合要求。由于申请材料需要严格审核，一旦发现材料存在问题，审批部门可能会要求重新提交或补充材料。因此，需要提前了解所需材料的具体要求和标准，并仔细核对材料是否齐全和符合要求。

2. 现场核查不合格。丰台区对食品经营和卫生方面有严格的要求，因此现场核查可能会更加严格。如果现场核查发现不符合相关规定，可能需要重新装修、调整设备或加强管理，以满足相关要求。

3. 相关法律法规和标准不熟悉。由于食品经营和卫生方面涉及的法律法规和标准非常多，如果对相关规定不熟悉，可能会导致申请被驳回或存在违规风险。因此，需要认真学习和了解相关法律法规和标准，并按照要求进行申请和运营。

4. 审批周期过长或审批结果不符合预期。由于审批周期较长，可能会存在各种不确定因素，如审批进度缓慢、审批结果不符合预期等。因此，需要提前做好心理准备和应急预案，及时与审批部门沟通，解决问题。

针对以上疑难问题，可以采取以下措施：

1. 提前了解所需材料的具体要求和标准，仔细核对材料是否齐全和符合要求。

2. 对现场核查不合格的情况，可以积极配合审批部门的要求，进行整改和调整。

3. 学习和了解相关法律法规和标准，按照要求进行申请和运营。

4. 提前做好心理准备和应急预案，及时与审批部门沟通，解决问题