海淀食品经营许可证办理过程中常见问题的处理方法如下：

1. 配合政府工作：在申请食品经营许可证的过程中，要积极配合政府的工作，提供相关资料和信息，并确保提交的资料和信息的真实性和完整性，避免提交假资料和其他违规行为。

2. 加强培训和交流活动：积极参加政府的培训和交流活动，加强自身的食品安全意识和管理水平，提高对食品经营许可证办理流程和要求的了解和认识。

3. 遵守相关法规和规定：在食品经营许可证办理过程中，商家需要遵守政府的相关法规和规定，确保食品经营的合法合规性。

4. 明确流程和要求：在办理食品经营许可证之前，商家需要了解相关政策和要求，明确食品经营许可证的申请流程和条件，避免走弯路或漏掉必要的步骤。

5. 提供完整的申请材料：在申请食品经营许可证时，需要提供完整的申请材料，包括企业法人营业执照、税务登记证、组织机构代码证、食品安全管理人员聘任证书、场地租赁协议等相关证件和材料。

6. 注意现场审查：现场审查是食品经营许可证办理中重要的一环，商家需要关注现场审查的情况，及时解决审查中出现的问题，确保现场审查顺利通过。

7. 及时解决问题：在食品经营许可证办理过程中，如遇到问题或困难，商家需要及时与相关部门或人士沟通协调，寻求帮助解决问题，避免因问题无法解决而影响办理进度和结果。

在海淀食品经营许可证办理过程中常见问题的处理方法需要商家积极配合政府的工作，遵守相关法规和规定，明确流程和要求，提供完整的申请材料，注意现场审查并及时解决问题。这样可以提高食品经营许可证办理的效率和质量，确保顺利经营。