门头沟地下空间备案、食品经营许可证、排水排污许可证的办理流程及材料如下：
一、门头沟地下空间备案
确定使用用途、范围和期限，并填写《北京市门头沟区地下空间使用备案申请表》。
提交备案申请材料：
使用人对使用用途、范围和期限的说明。
产权登记证明或者所有权人共同决定使用普通地下室的证明。
按规划用途使用的，提交规划文件；规划用途不明确的，提交城乡规划行政主管部门对使用用途确认的文件；改变规划用途的，提交城乡规划行政主管部门变更规划文件。
通风系统和空调系统卫生检测合格证明。
依法须经消防安全检查方可投入使用、营业的，提交公安消防机构出具的消防安全检查合格证明等。
备案申请材料齐全后，住房城乡建设行政主管部门将在15日内做出是否给予备案的决定。如果备案情况发生变更，使用人需要在30日内向住房城乡建设行政主管部门办理变更备案。
二、食品经营许可证
向所属区市场监督管理局（一般都是在行政服务中心）递交相关文书材料，材料齐全后，领取《接收材料凭证》或《受理通知书》后等待许可核准结果，需要现场核查的配合工商机关现场核查。
具有与经营的食品品种、数量相适应的食品原料处理和食品加工、包装、贮存等场所，保持该场所环境整洁，并与有毒、有害场所以及其污染源保持规定的距离。
领取《食品经营许可证申请书》，5个工作日内凭通知书领取食品经营许可证。
三、排水排污许可证
填写申请表格、提交相关资料：根据当地的要求，填写相应的申请表格，并准备相关材料，将申请表格和相关材料提交给当地。
受理并审核：会对申请进行审核，可能会需要申请人提供进一步的补充资料或修改方案。
现场检查：会安排人员进行现场检查，以验证申请人提交的资料和实际情况是否一致，并评估排放的影响和风险等。
颁发排污许可证：通过审核和现场检查后，会颁发排污许可证，并要求企业按照规定的条件和限制进行排放。
不同地区的办理流程和要求可能会有所不同，申请人需要提前了解并遵守相应的规定和要求。
