海淀区食品经营许可证和卫生许可证的代办流程及材料如下：

一、办理流程

1. 准备相关材料，并前往海淀区食品药品监督管理局进行咨询和预约。

2. 在预约时间内携带材料前往该局提交申请，并缴纳相关费用。

3. 该局将对申请材料进行审核，审核通过后进行现场检查。

4. 现场检查通过后，该局将颁发食品经营许可证。

二、办理材料

1. 食品经营许可证申请书。

2. 企业名称预先核准通知书复印件。

3. 卫生管理组织（架构）名单。

4. 各类场所卫生管理制度。

5. 主要生产设备清单。

6. 食品安全管理师任命书及身份证复印件。

7. 从业人员健康证。

8. 培训证明。

三、疑难问题解决

在办理食品经营许可证过程中，可能会遇到以下疑难问题：

1. 对相关法规和规定不够了解，导致申请材料不齐全或不符合要求。

2. 现场检查时发现卫生条件不符合要求，需要整改。

3. 从业人员健康证过期或缺失。

针对这些问题，可以采取以下措施进行解决：

1. 在提交申请前，认真阅读相关法规和规定，确保申请材料齐全、符合要求。

2. 在现场检查前，对经营场所和设备进行全面检查和清洁，确保卫生条件符合要求。

3. 及时安排从业人员进行健康检查，确保其健康证有效。

请注意，具体流程和所需材料可能会因地区和具体情况有所不同。因此，建议在办理前详细咨询当地相关部门或服务机构，以确保流程顺利和材料齐全。