超市与便利店在海淀区办理食品经营许可证的流程如下：

1. 申请：首先，申请人需要填写并提交食品经营许可证申请书。在申请书中，应包含企业的基本情况、食品安全管理制度、食品来源和食品经营设施等内容。同时，申请人需要准备所有相关证明文件，包括营业执照、卫生许可证、健康证明等。

2. 受理：提交申请后，海淀区食药监局将对申请材料进行审查。如果材料齐全且符合要求，将发放《材料接收凭证》或《受理通知书》。

3. 审查：在审查阶段，海淀区食药监局将对申请人的经营场所进行现场核查，核实其是否符合食品安全要求。此外，他们还会对食品来源、食品储存、加工和销售等环节进行审查，确保所有操作都符合相关规定。

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5. 批准：如果审查通过，海淀区食药监局将颁发食品经营许可证。许可证的有效期一般为5年，到期后需要进行续期。

6. 注意事项：整个流程可能需要多次办理和反复核查，以确保材料和信息的准确性和完整性。申请人需提前了解和准备相关证明文件，确保申请过程顺利。

以上就是超市和便利店在海淀区办理食品经营许可证的基本流程。由于具体情况可能会有所不同，建议在申请前咨询相关部门或人士，以确保申请过程顺利。