食品经营许可证和卫生许可证都是与食品卫生安全相关的证件，它们在以下六个方面存在明显的区别：

1. 定义：卫生许可证是单位和个人从事食品生产及餐饮店的经营活动，经卫生行政部门审查批准后，发给的卫生许可凭证，有注册备案的许可证号。而食品经营许可证是指在中华人民共和国境内，取得营业执照等，从事食品销售和餐饮服务活动的合法主体，经食品药品监督管理部门审查批准后发给的食品经营许可凭证。

2. 发放部门：卫生许可证由卫生行政部门发放，而食品经营许可证由食品药品监督管理部门发放。

3. 应用范围：卫生许可证主要针对一些卫生需要达到标准的行业或公共场所。食品经营许可证主要针对食品销售流通环节、餐饮服务领域。

4. 办理流程：卫生许可证和食品经营许可证的办理流程包括准备材料、填写申请表、递交申请、审核材料、现场检查、审批和领取证件等步骤，但具体流程和要求可能因地区而异。

5. 有效期：卫生许可证和食品经营许可证都有一定的有效期，需要在到期前进行续期或重新申请。

6. 法律责任：持有卫生许可证或食品经营许可证的企业在经营过程中需要遵守相关的法律法规，否则可能会面临法律责任。

总结来说，虽然两者都与食品安全相关，但具体的应用范围、办理流程和要求有所不同。因此，在实际运营中，企业需要根据自身的业务类型和需求，了解并遵守相关的法律法规，确保合法经营。

以上信息仅供参考，具体流程和要求可以咨询当地食品药品监督管理部门或卫生行政部门。