亦庄食品经营许可证的办理流程如下：

1. 准备相关材料，包括营业执照复印件、法人身份证复印件、从业人员身份证复印件和健康证、食品安全管理制度、店铺的平面图等。

2. 在当地市场监督管理局窗口进行现场申请，递交相关材料和申请表。

3. 现场工作人员会对提交的申请材料和申请表进行审核，确定申请材料无误后，会颁发“受理通知书”并安排现场检查。

4. 现场检查人员按照国家有关食品安全的检查标准，对机构的生产设备、车间、质量控制体系进行检查。

5. 合格的机构将在收到《食品生产或销售许可证》或《食品流通许可证》后进行食品制造或销售的业务。

以上流程仅供参考，具体要求可能会因地区和具体情况而有所不同。建议在办理前先咨询当地相关部门了解具体要求和流程。