通州区食品经营许可证的办理对于餐饮和超市业务来说是一个必要的环节。针对面积不足以及居民区内的特殊情况，以下是一些高效办理的解决方案：

对于餐饮和超市面积不足的问题，有几种可能的解决策略：

1. 优化空间布局：通过合理的设计和优化空间布局，使有限的面积得到大化利用。这包括合理安排厨房、储存区、就餐区等功能区域，确保食品安全和卫生标准得到满足。

2. 共享设施资源：考虑与其他商家合作，共享厨房设备、储存空间等资源。这不仅可以减少每个商家所需的使用面积，还能降低运营成本。

3. 申请小型餐饮许可证：如果餐饮业务规模较小，可以申请小型餐饮许可证。这类许可证对面积的要求相对较低，更适合小型餐饮经营者。

对于在居民区内经营的情况，以下是一些建议：

1. 遵守居民区规定：确保经营活动不违反居民区的相关规定，如噪音控制、垃圾处理等方面。与居民保持良好沟通，尽量避免对居民生活造成不便。

2. 加强食品安全管理：在居民区内经营，食品安全尤为重要。要确保食品来源可靠、加工过程卫生，并定期进行自查和接受相关部门的检查。

3. 考虑在线经营：如果实体店面面积受限，可以考虑开展在线经营，如外卖服务、网上超市等。这不仅可以扩大业务范围，还能减少对实体店面的依赖。

在办理通州区食品经营许可证时，建议提前了解相关政策和要求，确保申请材料齐全、准确。同时，可以咨询代办机构或当地食品药品监督管理部门，以获取更详细的指导和帮助。

请注意，具体的解决方案可能因地区、政策等因素而有所不同。因此，在实际操作中，建议根据当地实际情况灵活调整策略，并确保符合相关法规要求。