通州区办理食品经营许可证的流程通常包括以下步骤：

1. 准备相关材料：这些材料可能包括食品经营许可证申请表、营业执照、法人身份证复印件、食品安全管理制度等。确保所有文件都是新的并且符合通州区食品经营许可证的办理要求。

2. 在线预约并填写申请表格：在通州区政务服务中心网站进行在线预约，并填写食品经营许可证申请表格。请确保填写的信息准确无误。

3. 递交申请：将准备好的申请材料和申请表格一同递交给通州区食品安全监督管理部门。可以选择现场递交或者通过网站在线提交。

4. 等待现场核查：提交申请后，等待相关部门进行现场核查。核查的内容通常包括经营场所的卫生状况、食品安全管理制度的执行情况等。确保经营场所符合食品安全标准和卫生要求。

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7. 审核审批：食品安全监督管理部门会对申请材料进行审核，并在审核通过后颁发食品经营许可证。

需要准备的材料与初次申请时相似，但具体要求可能会因地区和具体情况而有所不同。以下是一般情况下重新申请食品经营许可证可能需要准备的材料清单：

1. 食品经营许可证重新申请书：填写完整的食品经营许可证重新申请表格，包括经营者的基本信息、经营场所、经营范围等内容。

2. 营业执照或其他主体资格证明文件复印件：确保营业执照或其他主体资格证明文件在有效期内，并且与申请食品经营许可证的主体一致。

3. 法定代表人（负责人）和食品安全管理人员的身份证明复印件：提供法定代表人（负责人）和食品安全管理人员的身份证复印件，确保身份信息的准确性。

4. 与食品经营相适应的主要设备设施布局、操作流程等文件：描述食品经营场所的主要设备设施布局、操作流程等，确保符合食品安全要求。

5. 食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录等保证食品安全的规章制度：提供已建立的食品安全自查、从业人员健康管理、进货查验记录等规章制度，以证明申请人对食品安全的重视和管理能力。

6. 经营场所的卫生状况和食品安全管理制度的整改报告：针对前次申请被拒绝的原因，提供经营场所的整改报告和食品安全管理制度的改进情况，证明已经采取了相应的改进措施。

7. 其他相关证明材料：根据具体情况，可能需要提供其他相关证明材料，如食品安全培训证书、食品检验报告等。

请注意，以上材料清单仅供参考，具体要求可能会因地区和具体情况而有所不同。在重新申请前，建议咨询通州区食品安全监督管理部门或相关，了解具体的重新申请要求和流程，以确保申请能够顺利进行。