代办北京通州排水排污许可证的具体流程可能因地区和政策的不同而有所差异。通常情况下，代办公司会根据企业的具体情况和需求，提供个性化的服务流程和报价。以下是一般的代办流程供参考：

1. 初步咨询：首先，企业可以通过电话、在线咨询或面谈等方式，与代办公司进行初步沟通。代办公司会了解企业的基本情况、业务需求和办理时间等。

2. 签订合同：在确认企业的需求和代办公司的服务范围后，双方会签订正式的合同。合同中会明确双方的权利和义务，以及代办服务的具体内容、费用、办理时间等细节。

3. 材料准备：代办公司会根据企业的具体情况，协助企业准备申请排水排污许可证所需的材料。这包括但不限于企业资质证明、排污情况说明、排水管网图等相关文件。

4. 提交申请：代办公司会代表企业向当地相关部门提交申请，并协助企业完成申请表格的填写和材料的提交。

5. 审核与评估：相关部门会对企业提交的材料进行审核和评估。这个过程中，代办公司会积极配合相关部门的工作，提供必要的支持和协助。

6. 许可证领取：如果企业的申请被批准，代办公司会协助企业领取许可证并进行相关手续的办理。

请注意，以上流程仅供参考，实际办理过程中可能会有所不同。建议企业在具体操作前，先咨询当地的或相关机构，了解具体的办理流程和要求。同时，选择正规的代办公司进行合作，以确保办理过程的合法性和安全性。