办理食品经营许可证的流程和材料如下：
流程：
填写食品经营许可证的申请表。
携带本人身份证、个体工商户营业执照或法人登记证等主体资格证明的原件或者复印件，从业人员身份证复印件和健康证，经过原件核对后，提交营业执照，然后制定食品安全管理制度。
绘制店铺的平面图，提交缴纳税费单据证明，证实自己所使用的水是正规自来水公司提供的。
到当地市场监督管理局提交如下资料：
《食品流通许可申请书》。
《名称预先核准通知书》复印件。
与食品经营相适应的经营场所的使用证明。
负责人及食品安全管理人员的身份证明。
与食品经营相适应的经营设备、工具清单。
与食品经营相适应的经营设施空间布局和操作流程的文件。
食品安全管理制度文本。
省、自治区、直辖市工商行政管理局规定的其他材料。
检测符合规定后，即可依法取得食品经营许可证。
所需材料：
食品经营许可申请表。
营业执照或者其他主体资格证明文件复印件。
法定代表人或负责人的身份证明复印件。
经营场所的具体位置，如方位图、与食品经营相适应的经营平面布局流程图，包括主要设备设施布局、操作流程等文件。
食品安全管理制度清单。
《授权委托书》及被委托人身份证明复印件，申请人委托代理人提出许可申请时提交。
其他材料。
在办理食品经营许可证的过程中，可能会遇到以下疑难问题：
如何填写申请表？
需要提交哪些材料？
如何制定食品安全管理制度？
如何提供经营场所的具体位置和相关文件？
如何准备食品安全管理制度清单？
如果委托代理人办理，需要提交哪些材料？
如果经营场所有多个楼层或区域，如何绘制平面图？
如果经营场所的设备、工具或设施有变动，需要重新申请许可证吗？
申请过程中需要支付哪些费用？如何支付？
如果申请被拒绝或需要修改材料，应该如何处理？
以上问题可能会因地区和具体情况而有所不同，建议在办理前咨询当地市场监督管理局或相关机构以获取更详细的信息和指导。
