在准备申请海淀区食品经营许可证的材料时，需要按照要求逐一准备。具体的准备步骤如下：

1. 确定申请资格和要求：了解海淀区食品经营许可证的申请资格和要求，确定自己是否符合申请条件。

2. 准备申请表格：在海淀区市场监督管理局的网站上下载食品经营许可证的申请表格，并按照要求填写。

3. 准备证明材料：根据申请表格的要求，准备相应的证明材料，如身份证、营业执照、食品安全管理制度等。

4. 准备场地证明材料：提供经营场地的证明材料，如租赁协议、房产证明等。

5. 准备设备和设施证明材料：提供经营设备和设施的证明材料，如设备清单、设备合格证明等。

6. 准备食品安全承诺书：根据要求准备食品安全承诺书，承诺遵守相关法律法规和标准。

7. 整理申请材料：将所有申请材料进行整理，并按照要求进行分类和装订。

在准备申请材料时，需要注意以下几点：

1. 确保所有材料真实、合法、有效，符合申请要求。

2. 按照要求提供相应的证明材料，如身份证、营业执照等需要提供原件和复印件。

3. 所有材料需要按照要求进行分类和装订，并进行详细的目录和说明。

4. 在提交申请之前，仔细核对所有材料，确保没有遗漏或错误。

如果需要代办机构协助办理，可以选择有信誉的代办机构，以确保办理流程顺利进行。