在北京市，代办排水排污许可证的费用会根据不同的代办机构和具体情况有所差异。以下是一般情况下的费用参考：

代理费用：代办机构会根据您的企业类型、规模、排水排污设施情况等因素，收取一定的代理费用。这个费用通常会涵盖咨询、材料准备、申请提交、现场勘查配合、许可证领取等全程服务。

材料准备费用：在申请过程中，可能需要准备一些特定的材料，如排水管网图、污水处理方案等。这些材料的制作和准备可能需要一定的费用，具体金额会根据材料的种类和数量而定。

其他费用：根据具体情况，还可能涉及一些其他费用，如加急费、特快专递费等。

请注意，以上费用仅供参考，具体费用还需要您与代办机构进行详细的沟通和协商。在选择代办机构时，建议您选择有资质、信誉良好的机构，确保服务质量和费用的合理性。

另外，根据国家相关规定，办理排水排污许可证本身并不收取费用，但代办机构提供的服务可能会收取一定的费用。因此，在选择代办机构时，一定要明确服务内容和费用，确保自己的权益得到保障。