海淀区超市、便利店食品经营许可证的办理流程如下：

准备材料：需要准备企业法人或个体工商户的有效身份证明、经营场所的租赁合同或产权证明、卫生许可证明及食品经营场所的平面布局图等。

提交申请：将准备好的材料提交给海淀区食品药品监督管理局。

审核材料：相关部门将对提交的材料进行审核，如有问题需要补充材料。

现场核查：审核通过后，相关部门将安排人员到食品经营场所进行现场核查。

批准发证：核查通过后，海淀区食品药品监督管理局会批准发放食品经营许可证。

在办理过程中，需要注意以下几点：

确保提交的所有材料真实、准确、完整。

确保经营场所符合相关卫生标准和规定。

如果经营场所涉及食品或饮料销售，需要注意食品安全要求，如原料选择、制作工艺、储存条件等，必须符合相关法规。

如果经营场所涉及儿童食品或饮料销售，需要注意儿童食品的安全要求，如原料选择、制作工艺、储存条件等，必须符合相关法规。

以上信息仅供参考，如有疑问或需要了解更多信息，建议咨询海淀区市场监督管理局或相关人士。