海淀区公司注册食品经营许可证的办理流程通常包括以下几个步骤：

确定公司类型和名称，并办理公司注册手续。

取得营业执照后，向海淀区食品药品监督管理部门申请食品经营许可证。

提交申请材料，包括营业执照、法定代表人身份证明、食品安全管理人员的身份证明和培训合格证明、经营场所证明、食品安全设施设备清单等。

接受现场审查，包括对经营场所和设施设备进行现场检查，确保符合食品安全要求。

审查通过后，领取食品经营许可证。

在办理食品经营许可证的过程中，需要注意以下几点细节：

申请材料必须真实、准确、完整，不得隐瞒真实情况或提供虚假材料。

经营场所和设施设备必须符合食品安全要求，包括卫生条件、设备布局、贮存条件等。

食品安全管理人员必须经过培训并取得合格证明，具备相应的食品安全知识和管理能力。

需要遵守食品安全法律法规和标准，确保所经营的食品符合要求，保障消费者的健康和安全。

以上是海淀区公司注册食品经营许可证的办理流程和材料细节的基本内容，具体细节可以咨询当地食品药品监督管理部门或代办机构。