海淀区食品代办许可证的程序包括以下几个步骤：

确定代办机构：选择正规的代办机构，如海淀区的代办机构等。

准备申请材料：根据代办机构的要求，准备并提交所需的申请材料。

提交申请：将申请材料提交给代办机构进行审核。

审核通过后，进行现场核查：审核通过后，代办机构会安排现场核查，检查经营场所、设施和食品等情况。

领取许可证：现场核查通过后，代办机构将颁发食品许可证，申请人可以到海淀区市场监督管理局领取或等待邮寄。

海淀区食品代办许可证所需材料包括：

食品经营许可证申请书。

营业执照或法人登记证等主体资格证明文件复印件。

法定代表人、食品安全管理员的身份证明、餐饮从业人员健康体检合格证明。

经营场所布局图。

企业食品安全管理制度。

合作生产单位的合作协议。

自动售货设备的产品合格证明。

第三方机构出具的对成品安全性的检验合格报告。

代理人应当提交授权委托书以及代理人的身份证明文件。

需要注意的是，不同类型和规模的食品经营企业需要的申请材料可能有所不同，建议在申请前详细了解相关政策和要求，并咨询代办机构或相关部门获取具体信息