门头沟地下空间备案及排水排污许可证的办理流程如下：

一、门头沟地下空间备案

确定使用用途、范围和期限，并填写《北京市门头沟区地下空间使用备案申请表》。

提交备案申请材料：使用人对使用用途、范围和期限的说明。产权登记证明或者所有权人共同决定使用普通地下室的证明。按规划用途使用的，提交规划文件；规划用途不明确的，提交城乡规划行政主管部门对使用用途确认的文件；改变规划用途的，提交城乡规划行政主管部门变更规划文件。通风系统和空调系统卫生检测合格证明。依法须经消防安全检查方可投入使用、营业的，提交公安消防机构出具的消防安全检查合格证明等。

备案申请材料齐全后，住房城乡建设行政主管部门将在15日内做出是否给予备案的决定。如果备案情况发生变更，使用人需要在30日内向住房城乡建设行政主管部门办理变更备案。

二、排水排污许可证

准备申请材料：具体所需材料可能会因地区和业务类型而有所不同，一般需要提供营业执照、法定代表人身份证明、房屋租赁合同或房产证明、消防验收合格证明等。

网上提交申请：登录相关政务服务平台，选择相应窗口进行在线填报。填写申请表时，请按照要求认真核对每一项内容，确保信息真实准确。

提交纸质材料：在线填报完成后，打印申请表并签字盖章，连同其他申请材料一并提交至审批部门。确保纸质材料齐全、整洁、清晰。

等待审批结果：提交材料后，审批部门会在承诺办结期限内给出审批结果。如果申请材料不符合要求，审批部门会出具补正材料通知书，申请人需按照要求补正材料。

领取排水排污许可证：审批通过后，申请人需携带身份证及营业执照原件到审批部门领取排水排污许可证。

以上流程仅供参考，具体流程可能因地区和政策而异。如果需要更详细的信息，建议咨询律师或当地。