海淀区小餐饮店食品许可证的办理流程如下：

前往海淀食品药品监督管理局办理餐饮食品许可证。

填写《食品许可证申请表》并提交到相关人员办公室。

申请人需在现场接受现场检查，并听取相关建议。

相关部门会对所填写的申请表进行初审。

如果初审合格后，则进行现场复审。

审核合格后领取餐饮食品许可证。

办理食品许可证需要准备以下材料：

企业法人或个体经营者的有效身份证件或营业执照副本。

已经购买或租赁的场所租赁合同或房产证明。

食品经营者卫生管理人员的健康证明。

食品供应商的合规证明。

食品经营场所的水、电、燃气等设施合规证明。

具备食品安全保障的操作规程、管理制度等。

其他可能要求的相关资料。

对于材料和流程中出现的疑难问题，可以咨询相关部门或者机构，比如咨询海淀区食品药品监督管理局，或者选择找代理机构进行代办。如果对具体步骤和要求仍然有疑问，可以咨询相关人士以获取准确信息。